| 報告時間：2023-11-28 |
| 報告地點：大四教室 |
| 指導老師：江信毅 |
| 學生：洪梓瑜 |
| 摘要 |
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從動物被馴化以來，人們為了因應當時的需求，根據育種目標設定各品種動物的選拔策略。研究選拔特徵有助於了解當動物處於選拔壓力下，動物重要表現型或變異的基因區域位置。本研究挑選了四種不同育種歷史的現代德國溫血馬，分別為特雷克納、荷爾斯泰因、漢諾威、奧登堡，而這四個品種現在的培育目標是提高其在超越障礙賽、馬場馬術、三日賽等比賽中的運動表現能力。本研究中使用了綜合單倍型評分（integrated Haplotype Score, iHS）、跨族群延伸單倍型純合性（cross-population Extended Haplotype Homozygosity, xpEHH）、同型合子基因型區間（Run of Homozygosity, ROH）等方式進行品種內及跨品種的分析。漢諾威和奧登堡表現出非常相似的iHS特徵，但透過xpEHH在多個染色體中發現了品種特異性。特雷克納在主成分分析中成為獨立族群，且表現出高數量的ROH。除了品種特異性外，本研究也在跨品種iHS分析中的1、4、7號染色體上找到了共享選拔訊號（shared selection signals）。透過分析iHS訊號與共享ROH找出來的選拔特徵，與數量性狀基因座（Quantitative Trait Loci, QTL）進行交互比對，篩選出了幾個具有相關功能的候選基因，像是影響肌肉功能（TPM1、TMOD2-3、MYO5A、MYO5C）、能量代謝及生長（AEBP1、RALGAPA2、IGFBP1、IGFBP3-4）、胚胎發育（HOXB-complex）和生育能力（THEGL、ZPBP1-2、TEX14、ZP1、SUN3、CFAP61）的基因，這些基因皆在現代德國溫血馬的運動能力上有所影響，已經成為現代運動馬共同的育種方向。然而本研究是從共同的選拔特徵中找出與現代育種目標相關的基因，這些基因實際上是否為控制運動表現的性狀，還需結合基因體資訊，統整溫血運動馬各方面的表現型進行相關驗證。 |
| 參考文獻 |
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