利用生物資訊方法辨識賽馬之候選基因以規劃其退休生活

報告時間:2024-03-04
報告地點:大四教室
指導老師:辛坤鎰
學生:洪梓瑜
摘要

       當賽馬退休後,由於其多為熱血馬,性格較為神經質,若要重新訓練,成為一般休閒騎乘的馬匹,尤其是給經驗較不足的騎手騎乘時,需特別謹慎小心。在馬匹重新訓練的過程中,也會因為每匹馬不同程度的個性差異,進而影響到訓練時長、訓練後的成果,以及訓練的效率。此研究旨在利用生物資訊方法,搜尋並辨識馬匹基因資料庫中跟性格相關之候選基因,協助規劃相關訓練,使賽馬在退休後能選擇適當的第二職業,以提高再訓練之效率。此研究應用101匹純種馬(Thoroughbred)之全基因體變異資料,將馬匹基因與五大性格特質(Big Five personality traits)相關的人類基因進行比對,在馬匹基因中確認了18個性格相關的候選基因。這些基因與EquCab3.0參考基因體相比,其中包含了55個變異,且涉及到非同義置換,因而影響到相關蛋白質的編碼。另外,此研究依據參考胺基酸與改變胺基酸間的分子量差異,以及疏水性程度的差異,評估等位基因頻率和對蛋白質功能的影響;本研究辨識到了15個可能影響馬匹性格的基因,但其與個性間的關聯性仍需進一步研究。儘管此類馬匹性格之研究闕如,本研究結果亦缺乏直接性的馬匹性格證據,但這項研究提供了一個生物資訊途徑的方法,搜索相關候選基因,望未來有馬匹行為的相關研究,能進一步驗證本研究的成果。

參考文獻
  • Yokomori, T., A. Ohnuma, T. Tozaki, T. Segawa, and T. Itou. 2023. Identification of Personality-Related Candidate Genes in Thoroughbred Racehorses Using a Bioinformatics- Based Approach Involving Functionally Annotated Human Genes. Animals 2023, 13(4), 769.