研究室成員合照
動物蛋白質體研究室



一、研究室簡介：
本研究室於2006年8月1日正式成立，主要任務為應用分子遺傳學及蛋白質體學技術平台進行家畜禽繁殖力與耐熱力分子標記之研究及畜禽重要基因之多態型分析，同時參與鳥禽類演化基因體(iEGG)與動物生物科技研究中心。
研究室主持人為黃三元老師，目前成員有碩士生6位及大學部學生2位。

研究室成員簡介
一、研究生
一、研究生    
1. 陳婷麗(Pantira Tungsirikul) Tel: (+886) 0986841726
E-mail: pantira.tung@gmail.com		 Education:
Senior high school, Sarasas Witaed Bangbuathong School in Bilingual Program. Bachelor of Animal Science and Agricultural Technology, Silpakorn University. Graduate student, Department of Animal Science, National Chung Hsing University. Personal interest: Travel
2. 洪瑋澤 電話：0975862396
電子郵件: axsz951475321@gmail.com		 學歷:
新竹高中
國立中興大學動科系
國立中興大學動物科學系碩士班
興趣: 羽球
3.林欣儀 電話：0985117208
電子郵件: lindidi39@gmail.com		 學歷:
興大附農畜產保健科
國立屏東科技大學動物科學與畜產系
國立中興大學動物科學系碩士班
經歷:
1.行政院農委會畜產試驗所恆春分所（研究助理）
2.瑞基海洋生物科技有限公司（研究助理）
學術專長技術：聚合酶連鎖反應限制酶片段長度多態性（PCR-RFLP）
興趣: 旅行、戲劇電影
4. 劉順仁 電話：0988125259
電子郵件:jm7020@hotmail.com		 學歷:
桃園市立內壢高級中等學校
國立中興大學動物科學系
國立中興大學農業企業經營管理碩士在職專班
經歷:
2012-2013 莊玉輝畜牧場 分娩舍負責人
2013-2014 財團法人動物科技研究所 牧場管理師
2014-迄今 財團法人農業科技研究院 牧場管理師
學術專長技術：豬隻批次化飼養管理
興趣: 慢跑、看電影、玩桌遊
5. 張書萍 電話：04-22870613轉275
電話：0972-867526
電子郵件: nykiri042234@gmail.com		 學歷: 國立中興大學動物科學系
興趣: 看醫療、偵探推理劇；打排球；聊天(?)
6. 林大富 電話：04-22870613轉275
傳真：04-22860265
電子郵件: davelin465@gmail.com		 學歷:中興大學動物科學系
興趣:騎車、聽音樂、跳舞、跑步

二、大學部學生

二、大學部學生    
1. 陳佳慧 電話：04-22870613轉275
電子郵件: hellen891002@gmail.com		 學歷:
台中市立大里高中
國立中興大學動物科學系
興趣: 繪畫、閱讀、騎馬
2. 劉恩睿 電話：04-22870613轉275
電子郵件: ejliu888@gmail.com		 學歷:
台北市立中崙高中
國立中興大學動物科學系
興趣: 羽球、排球、動漫、鋼琴、旅行

二、研究主題：
1.台灣土雞耐熱力相關之轉錄體與蛋白質體學研究
以全基因體微陣列晶片與蛋白質體學分析探尋不同品系台灣土雞在急性熱緊迫處理後mRNA及蛋白質之差異表現，以期找尋雞隻耐熱力之分子標誌。

2D-DIGE protein profile of the SYFs of layer-type L2 strain Taiwan country chickens.

Annotation of differentially expressed proteins in the SYFs of layer-type L2 strain Taiwan country chickens after acute heat stress.
(Cheng et al., 2018)

2.台灣土雞與不同品種豬隻全基因體單核苷酸多態型(SNPs)研究

Manhattan plot of the observed P values for body temperature change in the genome-wide association study between resistant vs. susceptible groups of broiler-type B strain Taiwan country chickens.

3.其他研究
應用蛋白質體學分析平台探討雞隻對奈米材料處理反應及足墊皮膚炎相關之蛋白質，並進行精子磷酸化蛋白質體之研究。

三、研究室現有之重要設備
本研究室已有蛋白質體學研究所需之基本設備（包括樣品製備、二維電泳、電泳膠片掃描及二維電泳影像分析軟體等）、具照相功能之位相差顯微鏡及二間可控制溫溼度之環控雞舍。此外，本研究室透過與清華大學及中國醫藥大學之合作補足相關研究不足之設備或研究平台，使相關研究得以順利進行。

本研究室之重要設備。A: IPGphor等電點聚焦系統；B: 蛋白質電泳設備；C: 低溫離心機；D: 位相差顯微鏡；E: 超音波細胞震碎儀；F: 電泳膠圖掃描儀；G: 冷凍真空乾燥機；H: 溫溼度調控雞舍。

四、近年發表報告：
  1.  Yuan, C.W. #, J.T. Huang#, C.C. Chen, P.C. Tang, J.W. Huang, J.J. Lin, S.Y. Huang*, S.E. Chen*. 2017. Evaluation of efficacy and toxicity of exfoliated silicate nanoclays as a feed additive for fumonisin detoxification. J. Agri. Food Chem. 65:6564-6571. doi: 10.1021/acs.jafc.7b02224# These authors contributed equally.
  2. Yu, Y.C., D.N. Lee, H.L. Li, and S.Y. Huang. 2017. Effect of single nucleotide polymorphisms in E. coli F4ab/ac resistance related genes on the growth traits of pigs. J. Chin. Soc. Anim. Sci. 46:321-330.
  3. Cheng, C.Y., W.L. Tu, C.J. Chen, H.L. Chan, C.F. Chen, H.H. Chen, P.C. Tang, Y.P. Lee, S.E. Chen, and S.Y. Huang. 2018. Functional genomics study on the acute heat stress response in small yellow follicles of a layer-type chickens. Sci. Rep. 8:1320. doi:10.1038/s41598-017-18335-5
  4. Cheng, C.Y., W.L. Tu, , C.J. Chen, H.L. Chan, C.F. Chen, H.H. Chen, P.C. Tang, Y.P. Lee, S.E. Chen, and S.Y. Huang. 2018. Proteomic analysis of thermal regulation of small yellow follicles in boiler-type Taiwan country chickens. J. Poult. Sci. 55:120-136.
  5. Tu, W.L., C.Y. Cheng, C.J. Chen, H.L. Chan, S.H. Wang, P.C. Tang, C.F. Chen, H.H. Chen, Y.P. Lee, S.E. Chen*, and S.Y. Huang*. 2018. Proteomic analysis of the hypothalamus of broiler-type Taiwan country chickens in response to acute heat stress. Anim. Sci. J. 89:1475-1485.
  6. Tu, W.L., C.Y. Cheng, C.J. Chen, H.L. Chan, S.H. Wang, P.C. Tang, C.F. Chen, Y.P. Lee, S.E. Chen, and S.Y. Huang*. 2018. Annotation of differential protein expression in the hypothalami of layer-type Taiwan country chickens in response to acute heat stress. J. Thermal Biol. 77:157-172.
  7. Zhuang, Z.X., S.C. Chang, C.J. Chen, H.L. Chan, M.J. Lin, H.Y. Liao, C.Y. Cheng, T.Y. Lin, Y.S. Jea, and S.Y. Huang. 2019. Effect of seasonal change on testicular protein expression in White Roman geese. Anim. Biotechnol. 30:43-56. doi: 10.1080/10495398.2018.1432488
  8. Chen, T.M., M.C. Lai, Y.H. Li, Y.L. Chan, C.H. Wu, Y.M. Wang, C.W. Chien, S.Y. Huang, H.S. Sun⁠⁎, and S.J. Tsai*. 2019. ⁠hnRNPM induces translation switch under hypoxia to promote colon cancer development. EBioMedicine 41:299-309. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ebiom.2019.02.059
  9.  Zhuang, Z.X., S.E. Chen, C.F. Chen, E.C. Lin, and S.Y. Huang*. 2019. Genome-wide association study on the body temperature changes of a broiler-type strain Taiwan country chickens under acute heat stress. J. Thermal Biol. 82:33-42.
  10.  Wang, S.H.#, C.Y. Cheng#, C.J. Chen, H.L. Chan, H.H. Chen, P.C. Tang, C.F. Chen, Y.P. Lee, and S.Y. Huang*. 2019. Acute heat stress changes protein expression in the testes of a broiler-type strain of Taiwan country chickens. Anim. Biotechnol. 30:129-145. doi=10.1080/10495398.2018.1446972# These authors contributed equally.
  11. Zhuang, Z.X., S.E. Chen, C.F. Chen, E.C. Lin*, and S.Y. Huang*. 2020. Genomic regions and pathways associated with thermotolerance in layer-type strain Taiwan indigenous chickens. J. Thermal Biol. 88: 102486. https://doi.org/10.1016/j.jtherbio.2019.102486
  12. Zheng, H.T., Z.X. Zhuang, C.J. Chen, H.-Y. Liao, H.L. Chen, H.C. Hsueh, C.F. Chen, S.E. Chen*, and S.Y. Huang*. 2021. Effect of acute heat stress on protein expression and histone modification in the adrenal gland of male layer-type country chickens. Sci. Rep. 11:6499. doi: 10.1038/s41598-021-85868-1
  13. 吳鍺湘、Wanwisa Chumngoen、陳朝榮、林德育、廖欣儀、譚發瑞*、黃三元*。2021。不同嫩度臺灣土雞股二頭肌之蛋白質差異表現。中畜會誌 50:137-174。
  14. Zhuang, Z.X., S.E. Chen, C.F. Chen, E.C. Lin, and S.Y. Huang*. 2022. Single-nucleotide polymorphisms in genes related to oxidative stress and ion channels in chickens are associated with semen quality and hormonal responses to thermal stress. J. Thermal Biol. 105:103220. doi: 10.1016/j.jtherbio.2022.103220.