專業必修學分：16學分
其他選修：14學分
| 必/選修 | 一年級課程 | 上學期 | 下學期 | 必選修 | 二年級課程 | 上學期 | 下學期 |
| 必修 | 專題討論(三) | 1 | 1 | 必修 | 專題討論(四) | 1 | 1 |
| 博士論文 | 6 | 6 |
| 必/選修 | 開設課程 | 上學期 | 下學期 | 必選修 | 開設課程 | 上學期 | 下學期 |
| 選修 | 動物科學文獻選讀(二) | 2 | 2 | 選修 | 動物資源經營學特論 | 3 | |
| 動物營養學特論(一) | 3 | 動物資源管理科學 | 3 | ||||
| 反芻動物營養學特論 | 2 | 應用動物行為學 | 3 | ||||
| 醣類與脂肪代謝特論 | 3 | 動物福祉特論 | 3 | ||||
| 動物選拔特論 | 3 | 家禽育種學特論 | 2 | ||||
| 動物內分泌學特論 | 3 | 演化遺傳與環境緊迫 | 2 | ||||
| 生殖生物學特論 | 3 | 消化道生理(二) | 2 | ||||
| 動物蛋白質體學特論 | 2 | 動物廢棄物處理特論 | 2 | ||||
| 抗體技術 | 2 | 動物生物技術 | 3 | ||||
| 生物技術與飼料 | 2 | 動物試驗設計 | 3 | ||||
| 豬學特論 | 2 | 動物試驗設計實習 | 1 | ||||
| 食品蛋白質 | 3 | 動物科學學術與論文寫作 | 2 | ||||
| 動物原料處理 | 3 | 應用分子遺傳學 | 3 | ||||
| 肉品學特論(一) | 3 | 計量遺傳學 | 3 | ||||
| 動物副產物處理特論 | 2 | 蛋品學特論 | 3 | ||||
| 動物產品貯藏學 | 3 | 乳品學特論 | 3 | ||||
| 細胞訊息傳遞導論 | 3 | 泌乳生理學 | 2 | ||||
| 動物生物技術 | 3 | 動物產品衛生學特論 | 2 | ||||
| 動物蛋白質體學實習 | 1 | 動物產品微生物學特論 | 2 | ||||
| 動物試驗設計實習 | 1 | 醣類與脂肪代謝特論 | 2 | ||||
| 動物臨床血液生化學 | 3 | 動物產品流變學 | 3 | ||||
| 食品添加物特論 | 2 | 動物廢棄物處理特論 | 2 | ||||
| 動物基因轉殖技術 | 2 | 配製食品概論 | 3 | ||||
| 動物科學國外研習 | 2 |
※表列課程實際開課情形以當學期為主，並開放研究所(含碩、博班)各年級共同修課。